Presente nel nostro Paese dal 1955, Pfizer Italia ha attualmente due sedi, una a Roma e una a Milano, e due stabilimenti, a Pisticci (Basilicata) e ad Ascoli Piceno (Marche).
In Italia, il gruppo di ricerca è impegnato in numerose sperimentazioni cliniche atte a produrre dati utili alla registrazione di farmaci in tutto il mondo. In particolare, la gran parte degli studi clinici condotti oggi in Italia è di tipo multicentrico internazionale con protocolli di fase I, II, III o IIIb.
L'investimento complessivo di Pfizer Italia in ricerca nel 2007 è stato pari a 8,3 milioni di euro, superando lo sforzo del 2006 durante il quale si sono investiti circa 6 milioni di euro. Con 938 centri e 70 ricercatori coinvolti (43 impiegati e 27 a contratto), la ricerca di Pfizer Italia si concentra soprattutto nell'area oncologica e in altre aree di notevole interesse: malattie infettive, sistema nervoso centrale, endocrinologia, malattie cardiovascolari, diabete, Uroginecologia, dolore e malattie di natura infiammatoria.
Lo stabilimento di Ascoli Piceno, nato nel 1972, produce per l'Italia, per gli Stati Uniti e per il Giappone, ed è l'unico, a livello mondiale, a produrre un nuovo farmaco per la cura dei tumori del tratto gastrointestinale.
Lo stabilimento di Pisticci, in provincia di Matera, è dedicato alla produzione di antinfettivi.